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更新于 1月16日

藥物算法工程師

2.6-5萬(wàn)
  • 北京大興區(qū)
  • 5-10年
  • 本科
  • 全職
  • 招3人

職位描述

PythonSchrodinger
崗位職責(zé):
1. 算法架構(gòu)與模型選型:負(fù)責(zé)藥物分子生成、合成路徑規(guī)劃及性質(zhì)預(yù)測(cè)系統(tǒng)的整體算法架構(gòu)設(shè)計(jì)。針對(duì)小分子、多肽以及復(fù)雜制劑輔料,進(jìn)行前沿深度學(xué)習(xí)模型的選型與評(píng)測(cè),確保模型在藥物研發(fā)場(chǎng)景下的高泛化性與預(yù)測(cè)精度。
2. 核心算法開(kāi)發(fā)與優(yōu)化:負(fù)責(zé)開(kāi)發(fā)高效的逆合成分析算法與合成路線預(yù)測(cè)模型。針對(duì)小分子和多肽,構(gòu)建結(jié)構(gòu)與性能的關(guān)聯(lián)模型,實(shí)現(xiàn)對(duì)溶解度、穩(wěn)定性、引濕性等理化性質(zhì)以及ADMET屬性的精準(zhǔn)預(yù)測(cè)。針對(duì)輔料與制劑方向,設(shè)計(jì)預(yù)測(cè)藥物-輔料配伍禁忌及處方優(yōu)化的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)模型。
3. 數(shù)據(jù)工程與特征構(gòu)建:構(gòu)建并維護(hù)藥物研發(fā)相關(guān)的多模態(tài)數(shù)據(jù)庫(kù)。負(fù)責(zé)化學(xué)結(jié)構(gòu)(SMILES/SELFIES)、分子指紋、三維構(gòu)象及制劑工藝參數(shù)的特征提取與工程化。處理異構(gòu)化實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),解決藥物化學(xué)數(shù)據(jù)中的樣本稀疏、標(biāo)簽噪聲及數(shù)據(jù)分布不均(OOD)等挑戰(zhàn)。
4. 跨學(xué)科協(xié)作與系統(tǒng)集成:與計(jì)算化學(xué)、合成化學(xué)及制劑開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)緊密配合,將算法模型集成至內(nèi)部藥物發(fā)現(xiàn)平臺(tái)或 ELN/LIMS 系統(tǒng)中,實(shí)現(xiàn)計(jì)算模擬與干濕實(shí)驗(yàn)的閉環(huán)聯(lián)動(dòng)。支持高通量篩選數(shù)據(jù)的自動(dòng)化分析,為實(shí)際研發(fā)決策提供量化的算法建議。
5. 模型部署與閉環(huán)優(yōu)化:建立算法模型的持續(xù)監(jiān)控與迭代機(jī)制,通過(guò)主動(dòng)學(xué)習(xí)(Active Learning)或強(qiáng)化學(xué)習(xí)手段,根據(jù)實(shí)驗(yàn)反饋不斷調(diào)優(yōu)算法。解決大規(guī)模分子庫(kù)檢索與實(shí)時(shí)預(yù)測(cè)中的計(jì)算性能瓶頸,確保算法在生產(chǎn)環(huán)境中的穩(wěn)定響應(yīng)與高效推理。
任職要求:
1. 學(xué)歷與經(jīng)驗(yàn):計(jì)算機(jī)科學(xué)、生物信息學(xué)、化學(xué)信息學(xué)、計(jì)算化學(xué)或相關(guān)專業(yè)碩士及以上學(xué)歷。具備 3 年及以上藥物研發(fā)相關(guān)算法經(jīng)驗(yàn),有小分子合成、多肽藥物或制劑穩(wěn)定性預(yù)測(cè)相關(guān)項(xiàng)目背景者優(yōu)先。
2. 算法技術(shù)棧:精通 Python 編程,熟練掌握 PyTorch 或 TensorFlow 等主流深度學(xué)習(xí)框架。深入理解常用機(jī)器學(xué)習(xí)算法及深度學(xué)習(xí)架構(gòu)。熟悉大規(guī)模語(yǔ)言模型(LLM)在化學(xué)序列(SMILES)處理上的應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)。
3. 化學(xué)信息學(xué)背景:熟練使用 RDKit、OpenEye 或 Schrodinger 等化學(xué)信息學(xué)工具包。理解基本有機(jī)化學(xué)反應(yīng)機(jī)理、多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)特性及常見(jiàn)藥用輔料的理化性質(zhì)。熟悉常用的公開(kāi)化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(如 ChEMBL, PubChem, ZINC, USP 等)。
4. 數(shù)據(jù)庫(kù)與數(shù)據(jù)管理:熟悉 SQL 及 NoSQL 數(shù)據(jù)庫(kù)的使用,具備處理大規(guī)模分子數(shù)據(jù)集的經(jīng)驗(yàn)。了解高性能計(jì)算(HPC)或 GPU 并行加速原理。
5. 工程能力與素質(zhì):熟悉 Git 版本控制與 Linux 開(kāi)發(fā)環(huán)境。具備優(yōu)秀的邏輯思維能力和跨學(xué)科溝通能力,能夠準(zhǔn)確理解化學(xué)家與制劑工程師的業(yè)務(wù)痛點(diǎn)并轉(zhuǎn)化為技術(shù)需求。具有持續(xù)學(xué)習(xí)前沿 AI for Science 文獻(xiàn)的熱情與能力。

工作地點(diǎn)

大興區(qū)北京諾康達(dá)醫(yī)藥科技股份有限公司

職位發(fā)布者

鄧璨/人事經(jīng)理

昨日活躍
立即溝通
公司Logo北京諾康達(dá)醫(yī)藥科技股份有限公司
北京諾康達(dá)醫(yī)藥科技股份有限公司成立于2013年7月,位于北京經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū),致力于解決由于生物智能高分子材料發(fā)展遲緩和制劑技術(shù)產(chǎn)業(yè)化研究不足導(dǎo)致的高端制劑和醫(yī)療器械匱乏的“卡脖子問(wèn)題”,是一家基于自主實(shí)驗(yàn)真實(shí)數(shù)據(jù)的AI大模型、自動(dòng)化設(shè)備開(kāi)發(fā)、項(xiàng)目技術(shù)開(kāi)發(fā)融合的醫(yī)藥研發(fā)平臺(tái)化應(yīng)用場(chǎng)景及自動(dòng)化中試和連續(xù)性大生產(chǎn)設(shè)備概念驗(yàn)證中心,填補(bǔ)高端智能高分子材料、高端制劑和醫(yī)療器械的國(guó)內(nèi)空白?;谡鎸?shí)數(shù)據(jù)搭建的數(shù)學(xué)建模體系并且通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)的數(shù)據(jù)不斷校驗(yàn)的AI模型+7*24小時(shí)無(wú)人值守的自動(dòng)化設(shè)備+在線自動(dòng)分析檢測(cè)設(shè)備構(gòu)成了諾康達(dá)三位一體的智能閉環(huán)研發(fā)體系—AVIRfinder體系。諾康達(dá)是國(guó)家“專精特新”小巨人企業(yè)、國(guó)家高新技術(shù)企業(yè)、國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)示范企業(yè)、北京市第二批兩業(yè)融合試點(diǎn)企業(yè),承擔(dān)3項(xiàng)團(tuán)體/行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),承擔(dān)和參與“十三五”國(guó)家重大新藥創(chuàng)制專項(xiàng)課題2項(xiàng)、國(guó)自然項(xiàng)目1個(gè)、北自然項(xiàng)目1個(gè)。已服務(wù)200家醫(yī)藥企業(yè)的產(chǎn)品升級(jí),累計(jì)向CDE申報(bào)受理436余個(gè)項(xiàng)目,獲得批件266個(gè),技術(shù)處于行業(yè)領(lǐng)先地位。
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