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更新于 1月8日

單細胞生物信息分析工程師

1-1.5萬
  • 武漢江夏區(qū)
  • 1-3年
  • 碩士
  • 全職
  • 招1人

職位描述

單細胞基因測序生信分析
崗位職責
1. 負責單細胞組學與空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)分析流程的研發(fā)、維護和優(yōu)化,包括但不限于scRNA-seq/snRNA-seq、scATAC-seq、單細胞多組學(RNA+ATAC/CITE-seq等)、空間轉(zhuǎn)錄組(10x Visium HD、Stereo-seq等)、單細胞全長轉(zhuǎn)錄組和空間全長轉(zhuǎn)錄組;
2. 獨立完成項目所需的分析與交付:數(shù)據(jù)質(zhì)控與去噪、去雙ts、批次矯正/整合、聚類與細胞類型注釋、差異分析、軌跡/擬時序、細胞通訊、空間域識別與空間差異表達、空間去卷積(deconvolution)及空間可視化等,并撰寫SOP與項目報告;
3. 將成熟流程進行標準化封裝與自動化(如Nextflow/Snakemake等),部署到服務器/HPC/平臺并完成測試、版本管理與可復現(xiàn)性保障;
4. 跟蹤單細胞與空間組學領(lǐng)域的文獻、算法和工具進展,結(jié)合項目目標提供更優(yōu)的分析方案與可解釋的生物學結(jié)論。
崗位要求:
1. 生物信息、計算生物學、生物學、醫(yī)學等相關(guān)專業(yè)碩士及以上學歷;有單細胞組學/空間轉(zhuǎn)錄組項目經(jīng)驗者優(yōu)先;
2. 熟悉單細胞與空間轉(zhuǎn)錄組常用分析方法與工具生態(tài)(如Seurat/Scanpy、Cell Ranger/STARsolo、Space Ranger、wf-single-cell及相關(guān)空間分析工具等),可獨立完成端到端分析;
3. 熟練使用R或Python進行數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計分析與可視化;熟悉Linux環(huán)境、腳本編寫與常用生信工具鏈;
4. 有流程化/工程化經(jīng)驗者優(yōu)先:Snakemake/Nextflow/WDL,Docker/Singularity,Git,HPC任務調(diào)度(Slurm/PBS等),以及良好的結(jié)果復現(xiàn)與交付意識;
5. 具備非模式動物或植物細胞注釋相關(guān)經(jīng)驗,熟悉非模式物種基因組特征,能獨立完成基于單細胞數(shù)據(jù)的物種特異性細胞類型注釋工作;
6. 具備良好的溝通協(xié)作能力、問題定位能力和學習能力,能推動跨團隊項目按期高質(zhì)量交付。

工作地點

江夏區(qū)高農(nóng)生物園(高新大道)武漢貝納科技有限公司

職位發(fā)布者

楊女士/人事專員

當前在線
立即溝通
公司Logo武漢貝納科技有限公司
武漢貝納科技有限公司(下稱“貝納基因”)成立于2012年,是亞太地區(qū)最大的納米孔測序服務商。作為國家高新技術(shù)企業(yè),貝納基因以納米孔測序技術(shù)應用為核心,開發(fā)多場景測序應用方案,打造二代測序、三代測序、生物信息開發(fā)與多組學應用聯(lián)合研究中心,致力于為高校、科研院所、醫(yī)院、研發(fā)型企業(yè)等提供專業(yè)、快捷、全方位的檢測及科研服務。以武漢為總部,貝納基因構(gòu)建了完善的全球服務網(wǎng)絡,在武漢、香港設有高標準測序?qū)嶒炇遥本?、南京、香港及美國等地設有分公司或辦事處,生產(chǎn)辦公面積超8000㎡。團隊實力雄厚,200余人的服務團隊中博士、碩士占比超過70%,核心成員曾在《Nature》《Science》系列雜志發(fā)表多篇學術(shù)成果。業(yè)務范圍廣泛,覆蓋國內(nèi)31個省市自治區(qū)、港澳臺,以及美國、歐洲、中東、東南亞等海外市場,累計服務客戶逾5000家。貝納基因作為亞太地區(qū)最大的納米孔測序服務商,在基因組應用領(lǐng)域,完成全球第一個大型復雜植物(菊花)的基因組測序組裝,穩(wěn)定向國內(nèi)外客戶提供讀長100kb、150kb、200kb的超長片段測序和T2T基因組解決方案。在轉(zhuǎn)錄組應用領(lǐng)域,國內(nèi)最早完成直接RNA測序(DRS)的商業(yè)轉(zhuǎn)化,提供全球獨家基于納米孔的LncDRS測序技術(shù)及全面的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究方案。在微生物應用領(lǐng)域,提出并推動基于納米孔測序的萬種微生物基因組完成圖計劃和十萬人的納米孔宏基因組研究計劃。下設全資子公司貝納醫(yī)學,專注于納米孔測序技術(shù)的臨床應用轉(zhuǎn)化與分子診斷試劑開發(fā),目前已圍繞病原微生物、腫瘤與遺傳三大領(lǐng)域推出一系列臨床診斷產(chǎn)品。未來,貝納基因?qū)允亍凹{米孔測序?qū)<摇钡男拍睿小皽y序計算提升客戶價值,基因解碼服務人類健康”的使命,在生命科學研究領(lǐng)域,為全球合作伙伴提供高標準、可信賴的解決方案;在臨床診斷領(lǐng)域,推出更精準、更快速的檢測產(chǎn)品。愿景多場景測序應用方案引領(lǐng)者使命測序計算提升客戶價值,基因解碼服務人類健康核心價值觀責任、誠信、學習、創(chuàng)新
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